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延边大学医学院前身是1948年10月1日成立的延边医科专门学校。1949年4月成立延边大学时，合并成为延边大学医学部。1996年，延边地区五所高校正式合并，延边医学院成为延边大学医学院;2005年4月，成立延边大学医学部，下设基础医学院、临床医学院、中医学院、药学院和护理学院。2018年根据医学教育改革发展需求，撤销延边大学医学部，原医学院、临床学院、中医学院合并，成立新的延边大学医学院。
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